T�tulo: Assessment of the Use of Topological Quantities in Structural Bioinformatics: A Practical Research in Bioinformatics Funded by NSERC
Editor: VDM Verlag
Fecha de publicaci�n: 2008
Idioma: Ingl�s
ISBN 10: 363904570X
ISBN 13: 9783639045703
Encuadernaci�n: Encuadernaci�n de tapa blanda
Estado: New

Acerca de

Sinopsis

Protein structure is complex trajectory in 3D space and it can be ab�stracted into a polygonal curve. Capturing structural properties from the Cartesian coordinates of thousands of atoms is an important step in performing structural analysis such as similarity detection and defining patterns. The objective of this research is to investigate the potential use of some knot theoretic quantities such as self-linking, R30 invariants and HEO vector for structural Bioinformatics applications. The work presented suggests that self-linking (writhing) can be used to identify a-helices. A revised sliding window approach together with 2 curve simplification methods were employed in the optimal window analysis to capture regions that maximize or mini�mize self-linking properties in a protein’s backbone trajectory. The accuracy of this method is significant although insufficient to be used for domain boundary identification. Most interestingly, the topo�logical properties of adjacent protein domains are significantly larger than for domain that are not adjacent within a gene. This experi�mental result suggests that proteins tend to evolve contiguous domains with polarized topological properties.

Rese�a del editor

Protein structure is complex trajectory in 3D space and it can be ab�stracted into a polygonal curve. Capturing structural properties from the Cartesian coordinates of thousands of atoms is an important step in performing structural analysis such as similarity detection and defining patterns. The objective of this research is to investigate the potential use of some knot theoretic quantities such as self-linking, R30 invariants and HEO vector for structural Bioinformatics applications. The work presented suggests that self-linking (writhing) can be used to identify a-helices. A revised sliding window approach together with 2 curve simplification methods were employed in the optimal window analysis to capture regions that maximize or mini�mize self-linking properties in a protein's backbone trajectory. The accuracy of this method is significant although insufficient to be used for domain boundary identification. Most interestingly, the topo�logical properties of adjacent protein domains are significantly larger than for domain that are not adjacent within a gene. This experi�mental result suggests that proteins tend to evolve contiguous domains with polarized topological properties.

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Si eres un consumidor puedes cancelar el presente contrato de acuerdo con lo indicado a continuaci�n. Son consumidores las personas f�sicas que act�en con un prop�sito ajeno a su actividad comercial, empresarial, oficio o profesi�n.

Documento de informaci�n al consumidor y usuario sobre el desistimiento

Derecho de desistimiento:

Tienes derecho a desistir del presente contrato en un plazo de 14 d�as naturales sin necesidad de justificaci�n.

El plazo de desistimiento expirar� a los 14 d�as naturales del d�a en que t� o un tercero que hayas indicado, distinto del transportista, adquiera la posesi�n material del �ltimo bien, componente o pieza.

Para ejercer el derecho de desistimiento, deber�s notificarnos a Ria Christie Collections, Suite B; (inside) ARUN House; ARUN, Arundel Road; Uxbridge Ind Est, UB8 2RR, Uxbridge, United Kingdom, +44 7727654838, de tu decisi�n de desistir del contrato a trav�s de una declaraci�n inequ�voca (por ejemplo, una carta enviada por correo postal, fax o correo electr�nico). Podr�s utilizar el modelo de formulario de desistimiento que figura a continuaci�n, aunque su uso no es obligatorio. Tienes asimismo la opci�n de cumplimentar y enviar electr�nicamente el modelo de formulario de desistimiento o cualquier otra declaraci�n inequ�voca a trav�s de nuestro sitio web a "Mis pedidos" en "Mi cuenta". Si recurres a esta opci�n, te comunicaremos sin demora en un soporte duradero (por ejemplo, por correo electr�nico) la recepci�n de dicho desistimiento.

Para cumplir el plazo de desistimiento, basta con que la comunicaci�n relativa al ejercicio por tu parte de este derecho sea enviada antes de que venza el plazo correspondiente.

Consecuencias del desistimiento:

En caso de desistimiento por tu parte, te devolveremos todos los pagos recibidos de ti, incluidos los gastos de entrega (con la excepci�n de los gastos adicionales resultantes de la elecci�n por tu parte de una modalidad de entrega diferente a la modalidad menos costosa de entrega ordinaria que ofrezcamos) sin ninguna demora indebida y, en todo caso, a m�s tardar 14 d�as naturales a partir de la fecha en la que se nos informes de tu decisi�n de desistir del presente contrato. Procederemos a efectuar dicho reembolso utilizando el mismo medio de pago empleado por ti para la transacci�n inicial, a no ser que hayas dispuesto expresamente lo contrario; en todo caso, no incurrir�s en ning�n gasto como consecuencia del reembolso.

Podremos retenerte el reembolso hasta haber recibido los bienes, o hasta que hayas presentado una prueba de la devoluci�n de los mismos, seg�n qu� condici�n se cumpla primero. Deber�s devolvernos o entregarnos directamente los bienes a Ria Christie Collections, Suite B; (inside) ARUN House; ARUN Building, Arundel Road; Uxbridge Ind Est, UB8 2RR, Uxbridge, United Kingdom, +44 7727654838, sin ninguna demora indebida y, en cualquier caso, a m�s tardar en el plazo de 14 d�as naturales a partir de la fecha en que nos comuniques tu decisi�n de desistimiento del contrato. Se considerar� cumplido el plazo si efect�as la devoluci�n de los bienes antes de que haya concluido dicho plazo. Deber�s asumir el coste directo de devoluci�n de los bienes. Solo ser�s responsable de la disminuci�n de valor de los bienes resultante de una manipulaci�n distinta a la necesaria para establecer la naturaleza, las caracter�sticas y el funcionamiento de los bienes.

Excepciones al derecho de desistimiento:

La entrega de peri�dicos, publicaciones especializadas o revistas con la excepci�n de contratos de suscripci�n; y
La entrega de contenido digital (incluyendo apps, MP3, etc.) que no hubiera sido entregado en un medio tangible (por ejemplo: CD o DVD), si al realizar tu pedido has aceptado que podemos proceder al env�o del producto y que no resulta posible su cancelaci�n una vez comienza la entrega.

Modelo de formulario de desistimiento

(S�lo debe cumplimentar y enviar el presente formulario si desea desistir del contrato)

A la atenci�n de: (Ria Christie Collections, Suite B; (inside) ARUN House; ARUN, Arundel Road; Uxbridge Ind Est, UB8 2RR, Uxbridge, United Kingdom, +44 7727654838)

Por la presente le comunico/comunicamos* que desisto de mi/desistimos de nuestro* contrato de venta del siguiente bien/prestaci�n del siguiente servicio*

Pedido el/recibido el*:

Nombre del consumidor y usuario o de los consumidores y usuarios:

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