Quantitative Proteomik mit Datenbanken in Java | Protein-Protein-Interaktionsnetze in Aktion

Christoph Gernert

ISBN 10: 3639301234 ISBN 13: 9783639301236

Editorial: VDM Verlag Dr. Müller, 2010

Idioma: Alem�n

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T�tulo

Quantitative Proteomik mit Datenbanken in Java | Protein-Protein-Interaktionsnetze in Aktion

Editor

VDM Verlag Dr. M�ller

Fecha de publicaci�n

2010

Idioma

Alem�n

ISBN 10

3639301234

ISBN 13

9783639301236

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Sinopsis

In dieser Arbeit werden High-Throughput-Daten aus der Massenspektrometrie erfolgreich mit Methoden aus der Informatik, wie Protein-Protein- Interaktionsdatenbanken und Visualisierungstechniken verbunden, um unter anderem Unterschiede in gesundem und Krebsgewebe aufzuzeigen oder den Verlauf einer Zell-Stimulierung zeitlich aufgel�st darzustellen. Wichtige biologische und technische Grundlagen werden zu Beginn verst�ndlich erkl�rt. Dabei wird auf die Werkzeuge der Proteomik, insbesondere auf die Massenspektrometrie, eingegangen. Das eingef�hrte System kann quantitative Proteomanalysen mittels iTRAQ? in Protein-Protein-Interaktionsnetzen darstellen. Diese Interaktionsnetze werden aus Informationen in aktuellen Publikationen generiert, die in einer relationalen Datenbank abgelegt sind, welche mittels Java an das System angebunden wird. M�gliche Signalwege in den Netzwerken werden aufgrund statistisch robuster Regulationsdaten aus der Massenspektrometrie mittels der "Divergence" berechnet. Die Divergence gibt dar�ber hinaus Aufschluss �ber die Mengen�nderung und strukturelle Ver�nderungen eines Proteins.

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