T�tulo: Predictive Quantitative Structure-Activity Relationship Models and their use for the Efficient Screening of Molecules
Editor: K.U.Leuven
Fecha de publicaci�n: 2011
Idioma: Ingl�s
ISBN 10: 9460183972
ISBN 13: 9789460183973
Encuadernaci�n: Paperback
Estado: Brand New

Acerca de

Sinopsis

This book explores two avenues where machine learning can help drug discovery: predictive models of in vivo or in vitro effects of molecules (known as Quantitative Structure-Activity Relationship or QSAR models), and the selection of efficient experiments based on such models.

In the first part, we present methods to improve the predictive power of graph kernel based molecule classifiers. The bias of existing graph kernels can be improved by augmenting atom-bond graphs with functional groups. This novel representation allows a machine learning algorithm to use both high-level functional and low-level atomic information, without any change to the kernel or learning algorithm. In internal validation tests, we observe consistently higher AUROCs for all tested kernels.

We also introduce a novel, efficient graph kernel called the Neighborhood Subgraph Pairwise Distance Kernel. The feature space of this kernel is the space of pairs of topological balls and the interpair distance. Using this kernel, a standard support vector machine outperforms or matches existing methods in the prediction of all investigated target properties: mutagenicity, in vivo toxicity, antiviral activity, and cancer suppression.

In the second part, we tackle the problem of efficient experimentation in drug discovery using optimization assisted by a learned surrogate model and we evaluate different experiment selection strategies. The algorithm is extended to accommodate drug discovery needs, such as the selection of many parallel experiments. The algorithm is integrated in an automated drug discovery platform, the robot scientist Eve. It is also applied to the optimization of the design of nanofiltration membranes.

This work is the Ph.D. thesis of Kurt De Grave.

Promotors:

Prof. dr. Luc De Raedt
Prof. dr. ir. Jan Ramon

Rese�a del editor

This work is the Ph.D. thesis of Kurt De Grave.

Promotors:

Prof. dr. Luc De Raedt
Prof. dr. ir. Jan Ramon

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Edward Bowditch Ltd
Exstowe, Exton, Exeter, EX3 0PP, United Kingdom

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Derecho a cancelaci�n

Si eres un consumidor puedes cancelar el presente contrato de acuerdo con lo indicado a continuaci�n. Son consumidores las personas f�sicas que act�en con un prop�sito ajeno a su actividad comercial, empresarial, oficio o profesi�n.

Documento de informaci�n al consumidor y usuario sobre el desistimiento

Derecho de desistimiento:

Tienes derecho a desistir del presente contrato en un plazo de 14 d�as naturales sin necesidad de justificaci�n.

El plazo de desistimiento expirar� a los 14 d�as naturales del d�a en que t� o un tercero que hayas indicado, distinto del transportista, adquiera la posesi�n material del �ltimo bien, componente o pieza.

Para ejercer el derecho de desistimiento, deber�s notificarnos a Revaluation Books, Exstowe, Exton, EX3 0PP, Exeter, United Kingdom, 44 1179083586, de tu decisi�n de desistir del contrato a trav�s de una declaraci�n inequ�voca (por ejemplo, una carta enviada por correo postal, fax o correo electr�nico). Podr�s utilizar el modelo de formulario de desistimiento que figura a continuaci�n, aunque su uso no es obligatorio. Tienes asimismo la opci�n de cumplimentar y enviar electr�nicamente el modelo de formulario de desistimiento o cualquier otra declaraci�n inequ�voca a trav�s de nuestro sitio web a "Mis pedidos" en "Mi cuenta". Si recurres a esta opci�n, te comunicaremos sin demora en un soporte duradero (por ejemplo, por correo electr�nico) la recepci�n de dicho desistimiento.

Para cumplir el plazo de desistimiento, basta con que la comunicaci�n relativa al ejercicio por tu parte de este derecho sea enviada antes de que venza el plazo correspondiente.

Consecuencias del desistimiento:

En caso de desistimiento por tu parte, te devolveremos todos los pagos recibidos de ti, incluidos los gastos de entrega (con la excepci�n de los gastos adicionales resultantes de la elecci�n por tu parte de una modalidad de entrega diferente a la modalidad menos costosa de entrega ordinaria que ofrezcamos) sin ninguna demora indebida y, en todo caso, a m�s tardar 14 d�as naturales a partir de la fecha en la que se nos informes de tu decisi�n de desistir del presente contrato. Procederemos a efectuar dicho reembolso utilizando el mismo medio de pago empleado por ti para la transacci�n inicial, a no ser que hayas dispuesto expresamente lo contrario; en todo caso, no incurrir�s en ning�n gasto como consecuencia del reembolso.

Podremos retenerte el reembolso hasta haber recibido los bienes, o hasta que hayas presentado una prueba de la devoluci�n de los mismos, seg�n qu� condici�n se cumpla primero. Deber�s devolvernos o entregarnos directamente los bienes a Revaluation Books, Edward Bowditch Ltd, Clifton Heights, Triangle West, BS8 1EJ, Bristol, United Kingdom, 44 1179083586, sin ninguna demora indebida y, en cualquier caso, a m�s tardar en el plazo de 14 d�as naturales a partir de la fecha en que nos comuniques tu decisi�n de desistimiento del contrato. Se considerar� cumplido el plazo si efect�as la devoluci�n de los bienes antes de que haya concluido dicho plazo. Deber�s asumir el coste directo de devoluci�n de los bienes. Solo ser�s responsable de la disminuci�n de valor de los bienes resultante de una manipulaci�n distinta a la necesaria para establecer la naturaleza, las caracter�sticas y el funcionamiento de los bienes.

Excepciones al derecho de desistimiento:

La entrega de peri�dicos, publicaciones especializadas o revistas con la excepci�n de contratos de suscripci�n; y
La entrega de contenido digital (incluyendo apps, software digital e-books, MP3, etc.) que no hubiera sido entregado en un medio tangible (por ejemplo: CD o DVD), si al realizar tu pedido has aceptado que podemos proceder al env�o del producto y que no resulta posible su cancelaci�n una vez comienza la entrega.

Modelo de formulario de desistimiento

(S�lo debe cumplimentar y enviar el presente formulario si desea desistir del contrato)

A la atenci�n de: (Revaluation Books, Exstowe, Exton, EX3 0PP, Exeter, United Kingdom, 44 1179083586)

Por la presente le comunico/comunicamos* que desisto de mi/desistimos de nuestro* contrato de venta del siguiente bien/prestaci�n del siguiente servicio*

Pedido el/recibido el*:

Nombre del consumidor y usuario o de los consumidores y usuarios:

Domicilio del consumidor y usuario o de los consumidores y usuarios:

Firma del consumidor y usuario o de los consumidores y usuarios (solo si el presente formulario se presenta en papel):

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