Parameter Advising for Multiple Sequence Alignment
Idioma: inglés
Editorial: Springer, Palgrave Macmillan Jun 2019, 2019
- Tapa blanda
- Nuevo
Librería: buchversandmimpf2000, Emtmannsberg, BAYE, Alemaniabuchversandmimpf2000
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This item is printed on demand - Print on Demand Titel. Neuware -Presents practical approaches to the pervasive question of how to choose parameter settings for sequence alignmentProvides links to proven software implementations that work well on real dataIntroduces a general framework for parameter advising of broad utility in bioinformatics and beyondSpringer-Verlag KG, Sachsenplatz 4-6, 1201 Wien 168 pp. Englisch.
N° de ref. del artículo 9783319879024
- Título
- Parameter Advising for Multiple Sequence Alignment
- Autor
- Dan Deblasio
- Editorial
- Springer, Palgrave Macmillan Jun 2019
- Año de publicación
- 2019
- Estado
- Neu
- Encuadernación
- Taschenbuch
- Idioma
- inglés
- ISBN 10
- 3319879022
- ISBN 13
- 9783319879024
- Peso del artículo
- 265 gramos
- Dimensiones
- 235x155x10 mm
- Serie
- Libro 13 de 21: Computational Biology
Presents practical approaches to the pervasive question of how to choose parameter settings for sequence alignment
Provides links to proven software implementations that work well on real data
Introduces a general framework for parameter advising of broad utility in bioinformatics and beyond
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Reseña del editor
This book develops a new approach called parameter advising for finding a parameter setting for a sequence aligner that yields a quality alignment of a given set of input sequences. In this framework, a parameter advisor is a procedure that automatically chooses a parameter setting for the input, and has two main ingredients:
(a) the set of parameter choices considered by the advisor, and
(b) an estimator of alignment accuracy used to rank alignments produced by the aligner.
On coupling a parameter advisor with an aligner, once the advisor is trained in a learning phase, the user simply inputs sequences to align, and receives an output alignment from the aligner, where the advisor has automatically selected the parameter setting.
The chapters first lay out the foundations of parameter advising, and then cover applications and extensions of advising. The content
· examines formulations of parameter advising and their computational complexity,
· develops methods for learning good accuracy estimators,
· presents approximation algorithms for finding good sets of parameter choices, and
· assesses software implementations of advising that perform well on real biological data.
Also explored are applications of parameter advising to
· adaptive local realignment, where advising is performed on local regions of the sequences to automatically adapt to varying mutation rates, and
· ensemble alignment, where advising is applied to an ensemble of aligners to effectively yield a new aligner of higher quality than the individual aligners in the ensemble.
The book concludes by offering future directions in advising research.
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Alternative Streitbeilegung:
Die Europäische Kommission stellt eine Plattform für die außergerichtliche Online-Streitbeilegung (OS-Plattform) bereit, aufrufbar unter http://ec.europa.eu/odr.
Derecho al desistimiento
Si es un consumidor, puede rescindir el contrato de acuerdo con lo siguiente. Por consumidor se entiende cualquier persona física que actúe con fines ajenos a su actividad comercial, empresarial, oficio o profesión.
Información sobre el derecho de desistimiento
Derecho legal de desistimiento
Tiene derecho a rescindir este contrato en un plazo de 14 días sin dar ningún motivo.
El periodo de desistimiento vencerá a los 14 días desde que usted, o un tercero que no sea el transportista e indicado por usted, adquiera la posesión física del último bien o del último lote o pieza.
Para ejercer el derecho de desistimiento, complete de forma electrónica y envíe una declaración clara en nuestro sitio web, desde "Mis compras" en "Mi cuenta". Le enviaremos sin demora un acuse de recibo de dicho desistimiento a través de un soporte duradero (por ejemplo, por correo electrónico).
Para cumplir con el plazo de desistimiento, basta con que envíe su comunicación relativa al ejercicio del derecho de desistimiento antes de que venza el periodo de desistimiento.
Efectos del desistimiento
Si rescinde este contrato, le reembolsaremos todos los pagos que hayamos recibido de usted, incluidos los gastos de envío (excepto los gastos adicionales que surjan si elige un tipo de envío que no sea el tipo de envío estándar más económico que ofrecemos).
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Efectuaremos el reembolso sin demoras indebidas y, a más tardar, 14 días después de que se nos informe de su decisión de rescindir este contrato.
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Excepciones al derecho de desistimiento
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