Functional Genomics: Methods and Protocols

Michael Kaufmann

ISBN 10: 1617794236 ISBN 13: 9781617794230

Editorial: Humana Press Inc., 2011

Idioma: Ingl�s

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Detalles bibliogr�ficos

T�tulo: Functional Genomics: Methods and Protocols
Editor: Humana Press Inc.
Fecha de publicaci�n: 2011
Idioma: Ingl�s
ISBN 10: 1617794236
ISBN 13: 9781617794230
Encuadernaci�n: Hardback
Edici�n: 2� Edici�n
Estado: New
Peso: 1038 gramos

Acerca de

Sinopsis

Part I: Bioinformatics

1. Prediction of Protein Tertiary Structures using MUFOLD

Jingfen Zhang, Zhiquan He, Qingguo Wang, Bogdan Barz, Ioan Kosztin, Yi Shang, and Dong Xu

2. Prediction of Protein Functions

Roy D. Sleator

3. Genome Wide Screens for Expressed Hypothetical Proteins

Claus Desler, Jon Ambaek Durhuus and Lene Juel Rasmussen

4. Self Custom-Made SFP Arrays for Non-Model Organisms

Ron Ophir and Amir Sherman

Part II: DNA Analysis

5. Construction and Analysis of Full-length and Normalized cDNA Libraries from Citrus

M Carmen Marques and Miguel A Perez-Amador

6. Assembling Linear DNA Templates for In vitro Transcription and Translation

Viktor Stein, Miriam Kaltenbach and Florian Hollfelder

7. Automated Computational Analysis of Genome-wide DNA Methylation Profiling Data from HELP-tagging Assays

Qiang Jing, Andrew McLellan, John M. Greally and Masako Suzuki

Part III: RNA Analysis

8. Detecting of RNA Editing Events in Human Cells using High-Throughput Sequencing

Iouri Chepelev

9. Comparative Study of Differential Gene Expression in Closely Related Bacterial Species by Comparative Hybridization

Ruisheng An and Parwinder S. Grewal

10. Whole Genome RT-qPCR MicroRNA Expression Profiling

Pieter Mestdagh, Stefaan Derveaux, Jo Vandesompele

11. Using Quantitative Real-Time Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction to Validate Gene Regulation by PTTG

Siva Kumar Panguluri and Sham S. Kakar

12. FRET-Based Real-Time DNA Microarrays

Arjang Hassibi, Haris Vikalo, Jos� Riechmann and Babak Hassibi

Part IV: Protein Analysis I: Quantification and Indentification

13. 2-D Gel Electrophoresis: Constructing 2D-Gel Proteome Reference Maps

Maria Paola Simula, Agata Notarpietro, Giuseppe Toffoli, and Valli De Re

14. The Use of Antigen Microarrays in Antibody Profiling

Kriszti�n Papp and J�zsef Prechl

15. Limited Proteolysis in Proteomics using Protease-immobilized Microreactors

Hiroshi Yamaguchi, Masaya Miyazaki and Hideaki Maeda

16. Mass Spectrometry for Protein Quantification in Biomarker Discovery

Mu Wang and Jinsam You

Part V: Protein Analysis II: Functional Characterization

17. High-throughput Microtitre Plate-based Assay for DNA Topoisomerases

James A Taylor, Nicolas P Burton and Anthony Maxwell

18. Microscale Thermophoresis as a Sensitive Method to Quantify Protein-Nucleic Acid Interactions in Solutions

Karina Zillner, Moran Jerabek-Willemsen, Stefan Duhr, Dieter Braun, Gernot L�ngst and Philipp Baaske

19 Bioluminescence Resonance Energy Transfer: an Emerging Tool for the Detection of Protein-protein Interaction in Living Cells

S�ren W. Gersting, Amelie S. Lotz-Havla and Ania C. Muntau

20 LuMPIS - Luciferase-based MBP-pull-down Protein Interaction Screening System

Mar�a G. Vizoso Pinto and Armin Baiker

21 Yeast Two-Hybrid Screens: Improvement of Array-based Screening Results by N- and C-terminally Tagged Fusion Proteins

Thorsten Stellberger, Roman H�user, Peter Uetz, and Albrecht von Brunn

22. Inducible microRNA-mediated Knockdown of the Endogenous Human Lamin A/C Gene

Ina Weidenfeld

23. Multiple-gene Silencing using Antisense RNAs in Escherichia Coli

Nobutaka Nakashima, Shan Goh, Liam Good and Tomohiro Tamura

24. Functional Screen of Zebrafish Deubiquitylating Enzymes by Morpholino Knockdown and in Situ Hybridization

William Ka Fai Tse and Yun-Jin Jiang

25. Silencing of Gene Expression by Gymnotic Delivery of Antisense Oligonucleotides

Harris S. Soifer, Troels Koch, Johnathan Lai, Bo Hansen, Anja Hoeg, Henrik Oerum and C.A. Stein

26. Polycistronic Expression of Interfering RNAs and RNA Plymerase III Promoters

Laura F. Steel and Viraj R. Sanghvi

De la contraportada

Over the last decade Life Science has undergone an accelerated evolution, culminating in the -omics era characterized by the development of a multitude of high throughput methods that are becoming more routinely applied in biochemistry labs. In Functional Genomics: Methods and Protocols, Second Edition expert researchers in the field detail many of the methods which are now commonly used for studies in the life sciences focusing on the dynamic aspects of the transcriptome, proteome and metabolome, respectively.Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and key tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Authoritative and practical, Functional Genomics: Methods and Protocols, Second Edition seeks to aid scientists in establishing or extending technologies and techniques in their laboratories.

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Si es un consumidor, puede rescindir el contrato de acuerdo con lo siguiente. Por consumidor se entiende cualquier persona f�sica que act�e con fines ajenos a su actividad comercial, empresarial, oficio o profesi�n.

Informaci�n sobre el derecho de desistimiento

Derecho legal de desistimiento

Tiene derecho a rescindir este contrato en un plazo de 14 d�as sin dar ning�n motivo.

El periodo de desistimiento vencer� a los 14 d�as desde que usted, o un tercero que no sea el transportista e indicado por usted, adquiera la posesi�n f�sica del �ltimo bien o del �ltimo lote o pieza.

Para ejercer el derecho de desistimiento, complete de forma electr�nica y env�e una declaraci�n clara en nuestro sitio web, desde "Mis compras" en "Mi cuenta". Le enviaremos sin demora un acuse de recibo de dicho desistimiento a trav�s de un soporte duradero (por ejemplo, por correo electr�nico).

Para cumplir con el plazo de desistimiento, basta con que env�e su comunicaci�n relativa al ejercicio del derecho de desistimiento antes de que venza el periodo de desistimiento.

Efectos del desistimiento

Si rescinde este contrato, le reembolsaremos todos los pagos que hayamos recibido de usted, incluidos los gastos de env�o (excepto los gastos adicionales que surjan si elige un tipo de env�o que no sea el tipo de env�o est�ndar m�s econ�mico que ofrecemos).

Podemos hacer una deducci�n del reembolso por la p�rdida de valor de cualquier bien suministrado, si la p�rdida es el resultado de una manipulaci�n innecesaria por su parte.

Efectuaremos el reembolso sin demoras indebidas y, a m�s tardar, 14 d�as despu�s de que se nos informe de su decisi�n de rescindir este contrato.

Efectuaremos el reembolso utilizando el mismo medio de pago que utiliz� para la transacci�n inicial, a menos que haya acordado expresamente lo contrario; en cualquier caso, no incurrir� en ning�n cargo como resultado de dicho reembolso.

Podremos retener el reembolso hasta que hayamos recibido los bienes o hasta que nos haya presentado una prueba de que los ha devuelto, lo que ocurra primero.

Deber� devolver los bienes o entregarlos a THE SAINT BOOKSTORE, Southport, United Kingdom, sin demoras indebidas y, en cualquier caso, en un plazo m�ximo de 14 d�as a partir del d�a en que nos comunique su desistimiento del presente contrato. El plazo se cumple si devuelve la mercanc�a antes de que venza el periodo de 14 d�as. Tendr� que asumir los gastos directos de devoluci�n de los bienes. Usted solo es responsable de la disminuci�n del valor de los bienes como resultado de una manipulaci�n distinta a la necesaria para establecer la naturaleza, las caracter�sticas y el funcionamiento de los bienes.

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El derecho de desistimiento no se aplica a lo siguiente:

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El suministro de contenido digital que no se proporcione en un soporte tangible (por ejemplo, en un CD o DVD) si, al hacer el pedido, acept� que pod�amos empezar a entregarlo y que no podr�a desistir una vez iniciada la entrega.

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