Evolutionary Analysis of Plants Using Chloroplast Proteome Sequences

Idioma: inglés

Editorial: LAP LAMBERT Academic Publishing Mrz 2012, 2012

3847375636 / 9783847375630

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This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -As more chloroplast genomes are sequenced their comparative analysis helps to identify conservedness between genomes and provide evidence on the evolutionary history of organisms. In order to increase the significance of similarity search, we defined three new parameters; Cumulative Sum of Homologs (CSH), Actual Proportion of Homologs (APH) and Homology Impact (HI) for post BLAST analysis. These parameters can also be used in other similarity search tools and are useful to identify unbiased conservation between genomes. Moreover, our work demonstrates use of missing data in phylogenetic analysis. The trees obtained from incomplete data sets have higher levels of bootstrap support for most of the nodes in comparison to the tree from complete data set. Further, comparative analysis of chloroplast proteomes identified hornworts as the transition link between bryophytes and pteridophytes. 168 pp. Englisch.

N° de ref. del artículo 9783847375630

Título
Evolutionary Analysis of Plants Using Chloroplast Proteome Sequences
Autor
Asheesh Shanker
Editorial
LAP LAMBERT Academic Publishing Mrz 2012
Año de publicación
2012
Estado
Neu
Encuadernación
Taschenbuch
Idioma
inglés
ISBN 10
3847375636
ISBN 13
9783847375630
Peso del artículo
268 gramos
Dimensiones
220x150x11 mm

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