Computational Approaches for Transcriptome Cancer Analysis by RNA-Seq
Idioma: inglés
Editorial: LAP LAMBERT Academic Publishing, 2016
- Tapa blanda
- Nuevo
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nach der Bestellung gedruckt Neuware - Printed after ordering - RNA-Seq provides an ideal platform to study the complete set of transcripts for a specific developmental stage or physiological condition. It reveals not only expression-level changes, but also structural changes in the coding sequences, including gene rearrangements. In this dissertation, I present my contributions to the development of computational tools for the robust and efficient analysis of RNA-Seq data to support cancer research. To automate the laborious and computationally intensive procedure of RNA-Seq data management, I worked on the development of Hydra, an RNA-Seq pipeline for the parallel processing and quality control of large numbers of samples. I then present QueryFuse, a novel gene-specific fusion-detection algorithm for aligned RNA-Seq data. It is designed to help biologists find and/or computationally validate fusions of interest quickly, and to annotate the detected events with visualization and detailed properties of the supporting reads. Finally, I contributed to the identification of a novel fusion event in lymphoma, with potential therapeutic implications in clinical samples. I validated this fusion in silico and by experimental validation.…
N° de ref. del artículo 9783659870873
- Título
- Computational Approaches for Transcriptome Cancer Analysis by RNA-Seq
- Autor
- Yuxiang Tan
- Editorial
- LAP LAMBERT Academic Publishing
- Año de publicación
- 2016
- Estado
- Neu
- Encuadernación
- Taschenbuch
- Idioma
- inglés
- ISBN 10
- 3659870870
- ISBN 13
- 9783659870873
- Peso del artículo
- 179 gramos
- Dimensiones
- 220x150x7 mm
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Para ejercer el derecho de desistimiento, complete de forma electrónica y envíe una declaración clara en nuestro sitio web, desde "Mis compras" en "Mi cuenta". Le enviaremos sin demora un acuse de recibo de dicho desistimiento a través de un soporte duradero (por ejemplo, por correo electrónico).
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