&Uumlber den AutorrnrnTiago Antao is a bioinformatician currently working in the field of genomics. A former computer scientist, Tiago moved into computational biology with an MSc in Bioinformatics from the Faculty of Sciences at the University.

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Detalles bibliogr�ficos

T�tulo

Bioinformatics with Python Cookbook - Third Edition: Use modern Python libraries and applications to solve real-world computational biology problems

Editor

Packt Publishing

Fecha de publicaci�n

2022

Idioma

Ingl�s

ISBN 10

1803236426

ISBN 13

9781803236421

Encuadernaci�n

Encuadernaci�n de tapa blanda

Edici�n

3� Edici�n

Estado

New

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Acerca de

Sinopsis

Discover modern, next-generation sequencing libraries from the powerful Python ecosystem to perform cutting-edge research and analyze large amounts of biological data

Key Features:

Perform complex bioinformatics analysis using the most essential Python libraries and applications
Implement next-generation sequencing, metagenomics, automating analysis, population genetics, and much more
Explore various statistical and machine learning techniques for bioinformatics data analysis

Book Description:

Bioinformatics is an active research field that uses a range of simple-to-advanced computations to extract valuable information from biological data, and this book will show you how to manage these tasks using Python.

This updated third edition of the Bioinformatics with Python Cookbook begins with a quick overview of the various tools and libraries in the Python ecosystem that will help you convert, analyze, and visualize biological datasets. Next, you'll cover key techniques for next-generation sequencing, single-cell analysis, genomics, metagenomics, population genetics, phylogenetics, and proteomics with the help of real-world examples. You'll learn how to work with important pipeline systems, such as Galaxy servers and Snakemake, and understand the various modules in Python for functional and asynchronous programming. This book will also help you explore topics such as SNP discovery using statistical approaches under high-performance computing frameworks, including Dask and Spark. In addition to this, you'll explore the application of machine learning algorithms in bioinformatics.

By the end of this bioinformatics Python book, you'll be equipped with the knowledge you need to implement the latest programming techniques and frameworks, empowering you to deal with bioinformatics data on every scale.

What You Will Learn:

Become well-versed with data processing libraries such as NumPy, pandas, arrow, and zarr in the context of bioinformatic analysis
Interact with genomic databases
Solve real-world problems in the fields of population genetics, phylogenetics, and proteomics
Build bioinformatics pipelines using a Galaxy server and Snakemake
Work with functools and itertools for functional programming
Perform parallel processing with Dask on biological data
Explore principal component analysis (PCA) techniques with scikit-learn

Who this book is for:

This book is for bioinformatics analysts, data scientists, computational biologists, researchers, and Python developers who want to address intermediate-to-advanced biological and bioinformatics problems. Working knowledge of the Python programming language is expected. Basic knowledge of biology will also be helpful.

Acerca del autor

Tiago Antao is a bioinformatician currently working in the field of genomics. A former computer scientist, Tiago moved into computational biology with an MSc in Bioinformatics from the Faculty of Sciences at the University of Porto (Portugal) and a PhD on the spread of drug-resistant malaria from the Liverpool School of Tropical Medicine (UK). Postdoctoral, Tiago has worked with human datasets at the University of Cambridge (UK) and with mosquito whole genome sequencing data at the University of Oxford (UK), before helping to set up the bioinformatics infrastructure at the University of Montana. He currently works as a data engineer in the biotechnology field in Boston, MA. He is one of the co-authors of Biopython, a major bioinformatics package written in Python.

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Die technischen Schritte zum Vertragsschluss, der Vertragsschluss selbst und die Korrekturm�glichkeiten erfolgen nach Ma�gabe der Regelungen "Zustandekommen des Vertrages" unserer Allgemeinen Gesch�ftsbedingungen (Teil I.).

Vertragssprache, Vertragstextspeicherung

3.1. Vertragssprache ist deutsch .

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Die wesentlichen Merkmale der Ware und/oder Dienstleistung finden sich im jeweiligen Angebot.

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letzte Aktualisierung: 23.10.2019

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