nach der Bestellung gedruckt Neuware - Printed after ordering - Written by internationally renowned experts, this book introduces emerging parallel architectures, their corresponding programming paradigms, and their bioinformatics applications. Providing two introductory chapters to supply necessary background on sequential bioinformatics algorithms and parallel architectures-such as multi-cores, Cell B.E., GPUs, FPGAs-it then presents parallelization strategies and performance evaluations for numerous state-of-the-art bioinformatics algorithms and tools. Topics include pairwise sequence alignment, multiple sequence alignment, BLAST, motif finding, and pattern matching. The book also covers sequence assembly, hidden Markov models, molecular dynamics, and evolutionary tree reconstruction.

N� de ref. del art�culo 9781439814888

Contactar al vendedor

Denunciar este art�culo

Detalles bibliogr�ficos

T�tulo: Bioinformatics : High Performance Parallel Computer Architectures
Editor: CRC Press
Fecha de publicaci�n: 2010
Idioma: Ingl�s
ISBN 10: 1439814880
ISBN 13: 9781439814888
Encuadernaci�n: Buch
Estado: Neu
Dimensiones: 240�mil�metros de ancho por 161 de alto por 25 de largo
Peso: 722 gramos

Acerca de

Sinopsis

New sequencing technologies have broken many experimental barriers to genome scale sequencing, leading to the extraction of huge quantities of sequence data. This expansion of biological databases established the need for new ways to harness and apply the astounding amount of available genomic information and convert it into substantive biological understanding.

A complilation of recent approaches from prominent researchers, Bioinformatics: High Performance Parallel Computer Architectures discusses how to take advantage of bioinformatics applications and algorithms on a variety of modern parallel architectures. Two factors continue to drive the increasing use of modern parallel computer architectures to address problems in computational biology and bioinformatics: high-throughput techniques for DNA sequencing and gene expression analysis―which have led to an exponential growth in the amount of digital biological data―and the multi- and many-core revolution within computer architecture.

Presenting key information about how to make optimal use of parallel architectures, this book:

Describes algorithms and tools including pairwise sequence alignment, multiple sequence alignment, BLAST, motif finding, pattern matching, sequence assembly, hidden Markov models, proteomics, and evolutionary tree reconstruction

Addresses GPGPU technology and the associated massively threaded CUDA programming model

Reviews FPGA architecture and programming

Presents several parallel algorithms for computing alignments on the Cell/BE architecture, including linear-space pairwise alignment, syntenic alignment, and spliced alignment

Assesses underlying concepts and advances in orchestrating the phylogenetic likelihood function on parallel computer architectures (ranging from FPGAs upto the IBM BlueGene/L supercomputer)

Covers several effective techniques to fully exploit the computing capability of many-core CUDA-enabled GPUs to accelerate protein sequence database searching, multiple sequence alignment, and motif finding

Explains a parallel CUDA-based method for correcting sequencing base-pair errors in HTSR data

Because the amount of publicly available sequence data is growing faster than single processor core performance speed, modern bioinformatics tools need to take advantage of parallel computer architectures. Now that the era of the many-core processor has begun, it is expected that future mainstream processors will be parallel systems. Beneficial to anyone actively involved in research and applications, this book helps you to get the most out of these tools and create optimal HPC solutions for bioinformatics.

Acerca del autor

Bertil Schmidt is Associate Professor at the School of Computer Engineering at Nanyang Technological University (NTU), Singapore. Prior to that, he was faculty member at the University of New South Wales and Senior Researcher at the University of Melbourne, Australia. At NTU he also held appointments as Program Director M.Sc. in Bioinformatics and Deputy Director of BMERC. Before coming to Singapore, he held research appointments at the Karlsruhe Institute of Technology (KIT) and RWTH Aachen. Bertil has been involved in the design and implementation of parallel algorithms and architectures for over a decade. He has worked extensively with fine-grained (e.g. GPUs, FPGAs, Cell BE), coarse-grained (clusters, grids) as well as hybrid parallel architectures. He has successfully applied these technologies to various domains including bioinformatics, image processing, multimedia video compression, and cryptography. He has published more than 35 journal papers in leading journals such as Journal of VLSI Signal Processing, Microelectronic Engineering, IEEE Transactions on Circuits and Systems II, IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems, IEEE Transactions on IT in Biomedicine, Journal of Parallel and Distributed Computing, Parallel Computing, Concurrency and Computation: Practice and Experience, Future Generation Computer Systems, Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Autoimmunity, and Computer Physics Communications.

"Sobre este t�tulo" puede pertenecer a otra edici�n de este libro.

Descripci�n de la librer�a

Das Unternehmen AHA-BUCH GmbH: Seit der Gr�ndung von AHA-BUCH im Juli 2005 ist unser Hauptziel, zufriedenen Kunden so schnell und so preisg�nstig wie m�glich ihren B�cherwunsch zu erf�llen. Unsere Firma besch�ftigt 16 Mitarbeiter, die nur ein Ziel kennen: den Kunden und seine W�nsche! Auf �ber 3700 m2 Fl�che haben wir �ber 100.000 B�cher, Modernes Antiquariat und Spiele auf Lager.

Ver la p�gina web de la librer�a

Informaci�n empresarial del vendedor

AHA-BUCH GmbH
Garlebsen 48, Einbeck, 37574, Germany

Condiciones de venta y env�o

Condiciones de venta

T�rminos y Condiciones Generales e Informaci�n del Cliente / Pol�tica de Privacidad

I. T�rminos y Condiciones Generales

� 1 Disposiciones b�sicas

(1)Los siguientes t�rminos y condiciones se aplican a todos los contratos que celebre con nosotros como proveedor (AHA-BUCH GmbH) a trav�s de las plataformas de Internet AbeBooks y/o ZVAB. A menos que se acuerde lo contrario, se objetar� la inclusi�n de cualquiera de sus propios t�rminos y condiciones utilizados por usted.
(2)Un consumidor en el sentid...

M�s informaci�n

Derecho a cancelaci�n

Si eres un consumidor puedes cancelar el presente contrato de acuerdo con lo indicado a continuaci�n. Son consumidores las personas f�sicas que act�en con un prop�sito ajeno a su actividad comercial, empresarial, oficio o profesi�n.

Documento de informaci�n al consumidor y usuario sobre el desistimiento

Derecho de desistimiento:

Tienes derecho a desistir del presente contrato en un plazo de 14 d�as naturales sin necesidad de justificaci�n.

El plazo de desistimiento expirar� a los 14 d�as naturales del d�a en que t� o un tercero que hayas indicado, distinto del transportista, adquiera la posesi�n material del �ltimo bien, componente o pieza.

Para ejercer el derecho de desistimiento, deber�s notificarnos a AHA-BUCH GmbH, Garlebsen 48, 37574, Einbeck, Germany, 49 55639996039, de tu decisi�n de desistir del contrato a trav�s de una declaraci�n inequ�voca (por ejemplo, una carta enviada por correo postal, fax o correo electr�nico). Podr�s utilizar el modelo de formulario de desistimiento que figura a continuaci�n, aunque su uso no es obligatorio. Tienes asimismo la opci�n de cumplimentar y enviar electr�nicamente el modelo de formulario de desistimiento o cualquier otra declaraci�n inequ�voca a trav�s de nuestro sitio web a "Mis pedidos" en "Mi cuenta". Si recurres a esta opci�n, te comunicaremos sin demora en un soporte duradero (por ejemplo, por correo electr�nico) la recepci�n de dicho desistimiento.

Para cumplir el plazo de desistimiento, basta con que la comunicaci�n relativa al ejercicio por tu parte de este derecho sea enviada antes de que venza el plazo correspondiente.

Consecuencias del desistimiento:

En caso de desistimiento por tu parte, te devolveremos todos los pagos recibidos de ti, incluidos los gastos de entrega (con la excepci�n de los gastos adicionales resultantes de la elecci�n por tu parte de una modalidad de entrega diferente a la modalidad menos costosa de entrega ordinaria que ofrezcamos) sin ninguna demora indebida y, en todo caso, a m�s tardar 14 d�as naturales a partir de la fecha en la que se nos informes de tu decisi�n de desistir del presente contrato. Procederemos a efectuar dicho reembolso utilizando el mismo medio de pago empleado por ti para la transacci�n inicial, a no ser que hayas dispuesto expresamente lo contrario; en todo caso, no incurrir�s en ning�n gasto como consecuencia del reembolso.

Podremos retenerte el reembolso hasta haber recibido los bienes, o hasta que hayas presentado una prueba de la devoluci�n de los mismos, seg�n qu� condici�n se cumpla primero. Deber�s devolvernos o entregarnos directamente los bienes a AHA-BUCH GmbH, Garlebsen 48, 37574, Einbeck, Germany, 49 55639996039, sin ninguna demora indebida y, en cualquier caso, a m�s tardar en el plazo de 14 d�as naturales a partir de la fecha en que nos comuniques tu decisi�n de desistimiento del contrato. Se considerar� cumplido el plazo si efect�as la devoluci�n de los bienes antes de que haya concluido dicho plazo. Deber�s asumir el coste directo de devoluci�n de los bienes. Solo ser�s responsable de la disminuci�n de valor de los bienes resultante de una manipulaci�n distinta a la necesaria para establecer la naturaleza, las caracter�sticas y el funcionamiento de los bienes.

Excepciones al derecho de desistimiento:

La entrega de peri�dicos, publicaciones especializadas o revistas con la excepci�n de contratos de suscripci�n; y
La entrega de contenido digital (incluyendo apps, software digital e-books, MP3, etc.) que no hubiera sido entregado en un medio tangible (por ejemplo: CD o DVD), si al realizar tu pedido has aceptado que podemos proceder al env�o del producto y que no resulta posible su cancelaci�n una vez comienza la entrega.

Modelo de formulario de desistimiento

(S�lo debe cumplimentar y enviar el presente formulario si desea desistir del contrato)

A la atenci�n de: (AHA-BUCH GmbH, Garlebsen 48, 37574, Einbeck, Germany, 49 55639996039)

Por la presente le comunico/comunicamos* que desisto de mi/desistimos de nuestro* contrato de venta del siguiente bien/prestaci�n del siguiente servicio*

Pedido el/recibido el*:

Nombre del consumidor y usuario o de los consumidores y usuarios:

Domicilio del consumidor y usuario o de los consumidores y usuarios:

Firma del consumidor y usuario o de los consumidores y usuarios (solo si el presente formulario se presenta en papel):

Fecha:

* Eliminar en su caso

Condiciones de env�o

Enviamos su pedido despu�s de recibirlos
para art�culos disponibles las �ltimas 24 horas,
para art�culos con suministro nocturno a m�s tardar 48 horas.
En caso de que necesitemos pedir un art�culo a nuestro proveedor, nuestro tiempo de env�o depende de la fecha de recepci�n de los art�culos, pero los art�culos se enviar�n el mismo d�a.

Nuestro objetivo es enviar los art�culos pedidos de la manera m�s r�pida, pero tambi�n m�s eficiente y segura a nuestros clientes.

Tarifas de env�o de Alemania a Estados Unidos de America

Tarifas de env�o de Alemania a Estados Unidos de America
Cantidad del pedido	De 30 a 40 d�as h�biles	De 7 a 14 d�as h�biles
Primer art�culo	EUR 63.61	EUR 73.61

Los plazos de entrega los establecen los vendedores y var�an seg�n el transportista y la ubicaci�n. Los pedidos que pasan por la aduana pueden sufrir retrasos y los compradores son responsables de los aranceles o tarifas asociadas. Los vendedores pueden ponerse en contacto con usted en relaci�n con cargos adicionales para cubrir cualquier aumento en los costes de env�o de los art�culos.

Informaci�n detallada sobre el vendedor