La Nerv a été décimée par la Seele et seuls quelques membres ont survécu au massacre. Alors qu'Asuka affronte, débordée, les 9 Eva Series, Gendô entraîne Rei dans les profondeurs afin de lui faire rencontrer Lilith... Quant à Shinji, il retrouve le courage suffisant pour voler au secours d'Asuka. Mais cela suffira-t-il ? L'heure du Troisième Impact a sonné et, alors que le Plan de Complémentarité de l'Homme se met enfin en marche, Shinji se retrouve malgré lui à en être l'instrument final.
Yoshiyuki Sadamoto a débuté sa carrière en tant que designer pour les célèbres studios d'animation Gainax. Il a notamment travaillé sur Les Ailes d'Honnéamise et Nadia ou le Secret de l'eau bleue, avant de commencer Evangelion, dessin animé au succès international. Parallèlement à l'animation, il reprend la trame d'Evangelion et l'adapte en bande dessinée, découvrant avec talent le métier de mangaka. Neon-Genesis Evangelion est devenu un manga culte au succès grandissant.